谭泰、何洛会引水陆兵二十万攻破南昌,杀金声桓。李成栋驰援又败死,江西失陷。济尔哈朗、孔有德破湘潭,杀何腾姣。顺治七年十一月,尚可喜破广州,孔有德破桂林。瞿式耜知道国事不可挽救,与大将张同敞安坐待死。清兵擒二人见孔有德,有德劝降,式耜道:“我中国男子,岂有失身?”有德道:“我是先圣(孔子)后裔,也还从顺,先生何得固执?”同敞厉声骂道:“你不过毛文龙家奴才,不要丢先圣的脸!”有德怒,式耜道:“这是张同敞先生,特来和我同死,不可凌辱。”有德请薙发,不许,又请当和尚,式耜道:“当和尚就是薙发,我发决不薙。”囚禁四十余日,式耜同敞直立(不跪)受斩刑死。
顺治六年,清军击平山西、陕西、甘肃;七年,平两广;八年,吴三桂乘川中诸将内讧,进兵夺取四川北部地。