后来王莽篡汉,西域都护府便被废置,即便是光武帝刘秀重新建立东汉,这西域都护府依旧被闲置,仿佛所有人都忘了一般。
在这段时间之内,北匈奴占领西域,屡次寇边大汉,起了不少的冲突。
或许是北匈奴太过暴烈,只知索取,后来西域十八国,包括如今被张扬所吞并的精绝、车师等国联名向大汉请求复立都护府。
这个时候,光武帝刘秀已经驾鹤西去,在位的皇帝是他的儿子刘肇,是为汉和帝。
刘肇接受了十八国的质子,然后以班超率军前往西域,为西域都护。
别看提起班超都说他三十六骑平定西域,这说的是他能力高强,可不是说他只有三十六骑。后来班超平定西域,深觉乌垒城的位置不好,便将西域都护府向西迁徙,定在了它乾城,用来震慑西域诸国。
不过这个西域都护府只存在了二十六年,随着班超年老,回转洛阳之后,西域发生暴乱,从此便没有了西域都护这一职位。虽然后来班超之子班勇再次平定西域,但这个职位便一直空缺了下来。
这也是为什么后来的王渊只称西域都护府长史,治所也定在高昌壁,因为不管是乌垒城还是它乾城,王渊都不敢去,只能在高昌壁勉力支撑,算是大汉在西域的最后一块遮羞布。