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培根哲学的目的是要复兴科学，突出地表现出务实精神。在批判阻碍科学发展的经院哲学和诸“假象”的过程中，他继承了前人的一些思想，总结了当时科学发展的成果，创立了近代唯物主义经验论。
（一）关于物质的学说
培根明确承认物质世界的客观性，表明了他的本体论的唯物主义性质。在他看来，“在自然中真正存在的东西”，只是按照一定的规律进行活动的个别物体。除此之外，就再没有别的。物质是自然万物的本原，世界在本质上是物质的。它的存在既不依赖于什么抽象的“本质”，也不依赖于人的意志。培根进一步从物质结构的角度说明物质是实在的。在他看来，构成物质的最小粒子应当是分子，它们各有其性质，并按照不同的排列构成各种事物，具有我们在自然事物中所能感觉到的各种质的规定性，如密度、温度、重量、体积、颜色和运动等。“用原子来说明物质，意味着用质的观点看待事物，就能体现物质的实在性。”[37]
（二）关于形式的学说
培根以形式的研究作为认识的基础和目的。他所说的“形式”，是指事物本身的内在规律。培根明确指出：
在自然中真正存在的东西，虽然除掉个别物体按照的规律进行纯粹个体的活动之外，没有什么别的，但是在哲学里面，就是这种规律以及对于这种规律的研究、发现和解释构成知识与活动的基础。而当我说到形式的时候，我的意思指的也就是这种规律及其所包含的部分。[38]
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